รายงานฉบับสมบูรณ์พ.ศ. 2564
บทบาทของกรดอะมิโนที่บริเวณเร่งต่อคุณสมบัติการใช้ไคตินของเอนไซม์บีต้า-เอ็น-อะซิ ทิลกลูโคซามินิเดสจากเชื้อแบคทีเรียในทะเล Vibrio harveyi
วิภา สุจินต์ มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีสุรนารี พ.ศ. 2564 ชื่อผู้แต่งข้างต้นเป็นข้อความจากระเบียนผลงาน ไม่ได้ผูกกับรหัสนักวิจัย จึงกดดูผลงานอื่นของบุคคลนี้ไม่ได้ — ในคลังนี้ 142,080 ผลงาน (63.6% ของทั้งหมด) มีชื่อผู้แต่งที่เชื่อมกับหน้าผู้แต่งได้ และ 60,298 ผลงาน (27.0%) มีผู้แต่งที่ผูกกับรหัสนักวิจัยจริง ส่วนอีก 81,382 ผลงานไม่มีข้อมูลผู้แต่งเลย (มีชื่อผู้แต่งเป็นข้อความอยู่ 142,009 ผลงาน = 63.5%)
บทคัดย่อ
บทคัอย่อ
การศึกษานี้ผู้วิจัยได้ทำการศึกษาโครงสร้างผลึกของเอนไซม์ VhGlcNAcase ที่มีและไม่มีสับสเตรท โดยพบว่า VhGlcNAcase ประกอบไปด้วยโดเมนหลักสามโดเมนได้แก่ โดเมนจับไคติน (CBD) เชื่อมกับโดเมน ?+? ตามด้วยโดเมนเร่งปฏิกิริยา (?/?)8 การหาน้ำหนักโมเลกุลของ VhGlcNAcase โดยวิธี gel filtration พบว่าโปรตีนมีน้ำหนักโมเลกุลเท่ากับหนึ่งหน่วยย่อยคือ 74 kDa แต่ในโครงสร้างผลึกพบจำนวน 2 โมเลกุลคือ MolA และ MolB ต่อหน่วยอสมมาตร โดยพบมีส่วนสัมผัสระหว่าง MolA และ MolB โดยแขนงข้างของกรดอะมิโน Gln16 ของ MolB ที่บริเวณ dimer interface จะบดบังทางเข้าของบริเวณเร่งของ MolA ไว้ ในการตกผลึกโปรตีนกับน้ำตาลสับเสตรท (GlcNAc)2 พบว่ามีแค่โมเลกุลของ GlcNAc ในโครงสร้างเชิงซ้อนของ VhGlcNAcase ทั้งนี้เกิดจากการที่สับเสตรทถูกย่อยให้เป็นน้ำตาล GlcNAc สองหน่วยโดยที่โมเลกุลของหน่วยย่อยหนึ่งโมเลกุลได้หลุดออกไปเหลือแค่น้ำตาล GlcNAc หน่วยที่สองที่บริเวณจับ -1 หรือน้ำตาล -1GlcNAc ได้ทำพันธะไฮโดรเจนกับ Gln16 และกรดอะมิโนมีขั้วรอบ ๆ ได้แก่ Arg274 Tyr530 Asp532 และ Glu584 และมีแรงไฮโดรโฟบิกกับกรดอะมิโนไม่มีขั้วได้แก่ Trp487 Trp546 Trp582 และ Trp505 จากการทำ site-directed mutagenesis พบว่าเอนไซม์กลายพันธุ์ D437A/N และ E438A/Q มีค่า catalytic efficiency น้อยมากแสดงถึงบทบาทการเป็นคู่เร่งปฏิกิริยาของ Asp437-Glu438 ในกลไกการเร่งปฏิกิริยาแบบ Substrate-assisted catalysis
คำสำคัญ
บีต้า-ดี-เอ็นอะซิติลกลูโคซะมินิเดสBeta-N-acetyl- glucosaminidasechitin degradationGH-20 glycoside hydrolaseGH-20 ไกลโคลไซด์ ไฮโดรเลสการสลายไคติน
งานวิจัยในหัวข้อใกล้เคียง
การแยกยีนและการศึกษาหน้าที่เอนไซม์ไคโตไบเอสในแบคทีเรียในทะเล Vibrio carchariae
วิภา สุจินต์ มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีสุรนารี พ.ศ. 2556 โครงสร้างและหน้าที่ของโดเมนจับไคตินของแฟมิลี 18 ไคติเนสจากเชื้อแบคทีเรีย vibrio harveyi
วิภา สุจินต์ มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีสุรนารี พ.ศ. 2559 คุณลักษณะและหน้าที่ของโปรตีนจับไคตินของแบคทีเรียในทะเล
วิภา สุจินต์ มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีสุรนารี พ.ศ. 2561 การศึกษาโครงสร้างและสมบัติในการใช้ไคติน ของเอนไซม์ไคติเนสเอกลายพันธุ์ จากเชื้อแบคทีเรีย Vibrio carchariae
วิภา สุจินต์ สาขาวิชาเคมี มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีสุรนารี พ.ศ. 2552 การศึกษาความจำเพาะต่อสับสเตรทของเอนไซม์ไคติเนส เอ จากเชื้อแบคทีเรีย Vibrio carchariae โดยเทคนิค site-directed mutagenesis :เพื่อประโยชน์ในการสลายไคตินโดยวิธีชีวภาพ
วิภา สุจินต์ มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีสุรนารี พ.ศ. 2552 การเข้าใจวิถีการสลายไคตินของแบคทีเรียในทะเล
วิภา สุจินต์ มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีสุรนารี พ.ศ. 2560 โมเดลเชิงโครงสร้างของโดเมนรับรู้ทางศักย์ไฟฟ้าของช่องโซเดียมในแบคทีเรียโดยอาศัยข้อมูลจากเทคนิคอีพีอาร์และการติดสปินที่ตำแหน่งจำเพาะต่างๆ บนโปรตีน
พรเทพ สมพรพิสุทธิ์ คณะวิทยาศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทบยาลัย พ.ศ. 2554 ระบบประมาณโครงสร้างสามมิติลำดับกรดอะมิโนของโปรตีนฮีแมกกลูตินินชนิด A สายพันธุ์ย่อย H5N1 บนระบบอินเตอร์เน็ต
จักร แสงมา มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ พ.ศ. 2552 การศึกษาโครงสร้างทางเคมีของสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพจากมะเดื่อ
อุดมเดชา พลเยี่ยม มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีราชมงคลพระนคร พ.ศ. 2556 ระบบประมาณโครงสร้างสามมิติลำดับกรดอะมิโนของโปรตีนฮีแมกกลูตินินชนิด A สายพันธุ์ย่อย H5N1 บนระบบอินเทอร์เน็ต
จักร แสงจักร มหาวิทยาลัยเกษตศาสตร์ พ.ศ. 2552