ความหลากหลายทางชีวภาพและวิวัฒนาการของจุลินทรีย์กลุ่ม Dictyostelid ในประเทศไทย
ชื่อผู้แต่งข้างต้นเป็นข้อความจากระเบียนผลงาน ไม่ได้ผูกกับรหัสนักวิจัย จึงกดดูผลงานอื่นของบุคคลนี้ไม่ได้ — ในคลังนี้ 142,080 ผลงาน (63.6% ของทั้งหมด) มีชื่อผู้แต่งที่เชื่อมกับหน้าผู้แต่งได้ และ 60,298 ผลงาน (27.0%) มีผู้แต่งที่ผูกกับรหัสนักวิจัยจริง ส่วนอีก 81,382 ผลงานไม่มีข้อมูลผู้แต่งเลย (มีชื่อผู้แต่งเป็นข้อความอยู่ 142,009 ผลงาน = 63.5%)
บทคัดย่อ
เชื้อจุลินทรีย์กลุ่มดิกทีโอสตีลิด (dictyostelids) เป็นจุลินทรีย์ที่มีความหลากหลายทางชีวภาพ ที่มีความสำคัญต่อระบบนิเวศและยังเป็นสิ่งมีชีวิตต้นแบบสำหรับการศึกษากระบวนการต่าง ๆ ของสิ่งมีชีวิตหลายเซลล์ โครงการวิจัยนี้เป็นการสำรวจความหลากหลายทางชีวภาพของเชื้อดิกทีโอสตีลิดในประเทศไทย รวมไปถึงพัฒนาเทคนิคการจัดจำแนกเชื้อดิกทีโอสตีลิดและการเขียนกระบวนการสำหรับค้นหา orthologous gene จากโปรตีโอมของเชื้อดิกทีโอสตีลิด ผู้วิจัยได้เก็บตัวอย่างดินตลอดทุกภูมิภาคของประเทศไทย เพื่อนำมาแยกเชื้อดิกทีโอสตีลิดและนำมาวิเคราะห์ทางไฟโลจีนีติกของยีน 18S rDNA ต่อมาผู้วิจัยพัฒนาเทคนิค SSCP-PCR โดยออกแบบดีเอ็นเอไพรเมอร์และศึกษาสภาวะและวิธีการวิเคราะห์ที่เหมาะสมสำหรับจำแนกเชื้อดิกทีโอสตีลิด นอกจากนี้ผู้วิจัยได้เขียนกระบวนการสำหรับค้นหา orthologous gene โดยการรวบรวมโปรแกรมต่าง ๆ และพัฒนาปรับแก้ข้อจำกัดของโปรแกรม ผลการศึกษาระบุว่าเชื้อดิกทีโอสตีลิดสามารถพบได้มากในช่วงฤดูฝนในทั่วทุกภูมิภาคของประเทศไทย โดยที่ประเทศไทยมีเชื้อดิกทีโอสตีลิดทั้งหมด 6 กลุ่ม จากทั้งหมด 7 กลุ่ม และจังหวัดอำนาจเจริญเป็นจังหวัดทีมีความหลากหลายทางชีวภาพมากที่สุด นอกจากนี้ยังพบว่าบริเวณ 5’ ของยีนสามารถใช้ในการจัดจำแนกเชื้อดิกทีโอสตีลิดได้ สำหรับเทคนิค SSCP-PCR ที่พัฒนาขึ้นสามารถนำมาใช้จำแนกเชื้อดิกทีโอสตีลิดได้จริงในอย่างน้อยระดับจีนัส หรือมากกว่าในจีนัสที่มีความหลากหลายสูง และสำหรับกระบวนการค้นหา orthologous gene ที่พัฒนาขึ้นเป็นชุดคำสั่งที่ประกอบด้วยโปรแกรม InParanoid และ BLAST ซึ่งสามารถนำไปใช้งานได้จริงโดยผ่านการทดสอบด้วยโปรตีโอมของเชื้อดิกทีโอสตีลิด 4 โปรตีโอม การศึกษาวิจัยนี้ทำให้ได้ข้อมูลความหลากหลายทางชีวภาพของเชื้อดิกทีโอสตีลิดทั่วประเทศไทย ซึ่งเป็นหนึ่งในทรัพยากรที่สำคัญของประเทศ รวมไปถึงเทคนิคสำหรับการจัดจำแนกเชื้อดิกทีโอสตีลิดในระดับจีนัส ที่ช่วยลดค่าใช้จ่ายและระยะเวลา นอกจากนี้ยังได้กระบวนการค้นหา orthologous gene ที่ใช้งานงาน สะดวก และพร้อมนำไปใช้งานต่อได้ทันที