รายงานฉบับสมบูรณ์พ.ศ. 2559
การอนุมานความสัมพันธ์เชิงเครือข่ายการควบคุมการแสดงออกของยีนใน Arthrospira platensis C1ภายใต้สภาวะอุณหภูมิสูง
ศวรรณี สุธีร์วรพงศ์ มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี พ.ศ. 2559 ชื่อผู้แต่งข้างต้นเป็นข้อความจากระเบียนผลงาน ไม่ได้ผูกกับรหัสนักวิจัย จึงกดดูผลงานอื่นของบุคคลนี้ไม่ได้ — ในคลังนี้ 142,080 ผลงาน (63.6% ของทั้งหมด) มีชื่อผู้แต่งที่เชื่อมกับหน้าผู้แต่งได้ และ 60,298 ผลงาน (27.0%) มีผู้แต่งที่ผูกกับรหัสนักวิจัยจริง ส่วนอีก 81,382 ผลงานไม่มีข้อมูลผู้แต่งเลย (มีชื่อผู้แต่งเป็นข้อความอยู่ 142,009 ผลงาน = 63.5%)
บทคัดย่อ
Arthrospira platensis (A. platensis)C1 คือไชยาโนแบคทีเรียชนิดหนึ่งซึ่งมีปริมาณโปรตีนมากและ
สารมูลค่าสูงหลายชนิด อุตสาหกรรมจำนวนมากให้ความสนใจในการใช้ A. platensis C1 เป็นแหล่งผลิตสารมูลค่า
สูงที่ต้องการ เป้าหมายของอุตสาหกรรมส่วนมาก ต้องการเพิ่มปริมาณน้ำหนักมวลในการผลิตซึ่งจำเป็นต้องเลี้ยงใน
กลางแจ้งซึ่ง A platensis C1 ต้องเผชิญกับความกดตันต่างๆ เช่น อุณหภูมิสูง การขาดสารอาหาร และอื่นๆ ใน
การศึกษานี้ เราได้มุ่งเน้นในการศึกษาการตอบสนองของ A. platensis C1 ต่อสภาวะอุณหภูมิสูง ในขั้นแรกเราได้
วิเคราะห์ข้อมูลไมโครอาร์เรย์ของ A platensis C1 ภายใต้สภาวะอุณหภูมิสูง และได้ยืนจำนวน 250 ยืนที่
ตอบสนองต่อสภาวะดังกล่าว ยืนเหล่านี้ถูกแบ่งออกเป็น 5 กลุ่มตามรูปแบบการแสดงออกของยีน จากนั้น เราคันหา
Motif ที่มีร่วมกันของยีนที่แสดงออกร่วมกัน และเปรียบเทียบ Motif ที่ทำนายได้ด้วย Motif ของสิ่งมีชีวิตชนิตโปร
คาริโอตที่มีการศึกษาไว้แล้ว เราจึงทำนายความสัมพันธ์เชิงควบคุมของยีน โดยยีนที่มีการแสดงออกร่วมกันและมี
Motif ร่วมกันจะถือว่ามีความสัมพันธ์กัน และมีการทำนาย Regulator ที่มีแนวโน้มที่จะจับกับ Motif ที่ทำนายได้
สุดท้าย เราได้สร้างเครือข่ายควบคุมการแสดงออกของยีนที่เป็นกลไกการตอบสนองต่อสภาวะอุณหภูมิสูงของ A
platensis C1 ภายใต้สภาวะอุณหภูมิสูง
คำสำคัญ
ArthrospiraCo-regulationtranscriptional regulatory networkco-expressionco-localizationplatensis
งานวิจัยในหัวข้อใกล้เคียง
การค้นหาและศึกษาคุณสมบัติของยีนจากข้อมูลจีโนม ไซยาโนแบคทีเรีย Arthrospira (Spirulina) platensis C1
พีรดา พรหมมีเนตร มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี พ.ศ. 2557 การศึกษาการแสดงออกของยีนที่ตอบสนองต่ออุณหภูมิใน Spirulina platensis C1 ด้วยเทคนิค DNA Micorarray
กัลยาณี ไพฑูรย์รังสฤษดิ์ มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี พ.ศ. 2554 การปรับปรุงความแม่นยาของแบบจาลองวิถีเมตาบอลิซึมระดับจีโนมของ arthrospira platensis c1 โดยวิธีการระบุปฏิกิริยาการขนส่งและการศึกษาเปรียบเทียบเชิงจีโนม
ปรีชา ปทุมเจริญผล มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี พ.ศ. 2558 การคัดเลือกสายพันธุ์ Mutants ของสาหร่ายสไปรูลิน่าสายพันธุ์ C1 ที่มีความไว และทนทานต่อการเปลี่ยนแปลงอุณหภูมิ
พุฒณิชา พึ่งเจริญ มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี พ.ศ. 2557 การพัฒนาเทคโนโลยีการใช้ พีจีพีอาร์ เพื่อส่งเสริมการเจริญเติบโต การควบคุมและชักนำภูมิต้านทานโรคสำคัญในอ้อย
สุพจน์ กาเซ็ม สำนักงานการวิจัยแห่งชาติ (วช.) พ.ศ. 2563 การศึกษาการแสดงออกของยีนสร้างเอนไซม์ restriction-modification ที่มีผลต่อประสิทธิภาพการส่งถ่ายดีเอ็นเอใน Spirulina platensis C1
สุดารัตน์ ดุลสวัสดิ์ มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี พ.ศ. 2554 การโคลนและการวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีนไซแลนเนส จากแบคทีเรียน้ำพุร้อน
จิรวรรณ อภิรักษากร มหาวิทยาลัยขอนแก่น พ.ศ. 2559 การตรวจหาและวิเคราะห์การแสดงออกของ group II intron ในจีโนม Spirulina platensis C1
สุดารัตน์ ดุลสวัสดิ์ มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี พ.ศ. 2557 การโคลนยีนที่ผลิตเอนไซม์เชื่อมสายดีเอนเอของสาหร่ายไซยาโนแบคทีเรีย Synechosystis sp. PCC 6803 สู่ระบบการแสดงออก
เชิดศักดิ์ มณีรัตนรุ่งโรจน์ สถาบันเทคโนโลยีพระจอมเกล้าเจ้าคุณทหารลาดกระบัง พ.ศ. 2557 การวิเคราะห์หายีนและหน้าที่ของยีนในจีโนมของเชื้อพลาสโมเดียมฟาซิพารัมโดยวิธีชีวสารสนเทศ
อัศวิน มีชัย สถาบันพัฒนาและฝึกอบรมโรงงานต้นแบบ มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี พ.ศ. 2551