รายงานฉบับสมบูรณ์พ.ศ. 2559
การประยุกต์ใช้การคำนวณ QM/MM เพื่ออธิบายกลไกปฏิกิริยาของเอนไซม์ Histone Deacetylase 8 และ Dimethyl Malate Lyase กับศักยภาพทางเภสัชวิทยา
แมทธิวพอล กลีสัน มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ พ.ศ. 2559 ชื่อผู้แต่งข้างต้นเป็นข้อความจากระเบียนผลงาน ไม่ได้ผูกกับรหัสนักวิจัย จึงกดดูผลงานอื่นของบุคคลนี้ไม่ได้ — ในคลังนี้ 142,080 ผลงาน (63.6% ของทั้งหมด) มีชื่อผู้แต่งที่เชื่อมกับหน้าผู้แต่งได้ และ 60,298 ผลงาน (27.0%) มีผู้แต่งที่ผูกกับรหัสนักวิจัยจริง ส่วนอีก 81,382 ผลงานไม่มีข้อมูลผู้แต่งเลย (มีชื่อผู้แต่งเป็นข้อความอยู่ 142,009 ผลงาน = 63.5%)
บทคัดย่อ
การคำนวณเคมีที่มีบทบาทสำคัญในการสนับสนุนขั้นเริ่มต้นของการวิจัยค้นพบยาเสพติด วิธีการ
ดังกล่าวจะไม่ได้โดยไม่มีข้อบกพร่อง แต่พวกเขาจะมีประโยชน์มากในการพัฒนาและการทดสอบของ
hypothesises เช่นเดียวกับการจัดลำดับความสำคัญในแง่มุมของกระบวนการสำรวจ ในบทความนี้
เราจะหารือถึงปัญหาที่พบบ่อยบางคนที่มีการจ้างงานในระดับโมเลกุลกล (QM / MM) วิธีไฮบริ
ดควอนตัมกล / ในการใช้งานการค้นพบยาเสพติดบางอย่าง วิธี QM / MM ให้หมายถึงการจำลอง
ระบบชีวภาพขนาดใหญ่สำหรับคำใช้จ่ายในการคำนวณในระดับปานกลางเรใช้วิธีการในการ
ประเมิน metalloproteins ที่ deacetylases มนุษย์ (HDACs) ซึ่งเป็นเป้าหมายสำหรับความหลาก
หลายของเงื่อนไขทางการแพทย์รวมทั้งโรคเกี่ยวกับระบบประสาทและการติดเชื้อเอชไอวี
metalloproteins โดยเฉพาะมีความท้าทายในการจำลองการใช้วิธีการเชิงประจักษ์อย่างรวดเร็วที่ต้อง
การในอุตสาหกรรมยาที่ เรารายงานการใช้งานของ QM รูปแบบของคำใช้จ่ายในการคำนวณในระดับ
ปานกลางเท่นั้น / เดือนในการสำรวจการใช้งานเว็บไซต์เช่นเดียวกับการเร่งปฏิกิริยาของมัน นอกจาก
นี้เรายังแสดงให้เห็นถึงความคุ้มค่าของวิธีการที่มากกว่ากลุ่ม QM ขนาดเล็กและแสดงให้เห็นว่าวิธีการ
ที่มีความสามารถในการอธิบายความแตกต่างเกี่ยวกับการเคลื่อนไหวที่เกี่ยวข้องกับการเปลี่ยน Zn2 +
ด้วยโลหะปัจจัยร่วมอื่น ๆ
คำสำคัญ
QM/MMReaction mechanismsDMMLHDAC8structure based design
งานวิจัยในหัวข้อใกล้เคียง
การใช้ open-sources software สำหรับวิธี md-oniom โดยการใช้ gpgpu เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพการโมเดลให้ดียิ่งขึ้น
วีรมลล์ ไวลิขิต มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ พ.ศ. 2552 การพัฒนาโมเลกุลตรวจติดตามเพื่อประยุกต์ใช้เป็นเครื่องมือสำหรับตรวจวิเคราะห์ทางห้องปฏิบัติการ
ธนาวุฒิ ตันติมงคลวัฒน์ คณะเทคนิคการแพทย์ มหาวิทยาลัยมหิดล พ.ศ. 2552 การจำลองแบบและการออกเเบบโมเลกุลด้วยการคำนวณเพื่อเข้าใจอย่างลึกซึ้ง ถึงอันตรกิริยาระหว่างสารยับยั้ง ที่มีความจำเพาะสูงในการรักษาโรควัณโรคที่มีต่อ เอนไซม์
พรพรรณ พึ่งโพธิ์ มหาวิทยาลัยอุบลราชธานี พ.ศ. 2556 การจำลองแบบและการออกแบบโมเลกุลด้วยการคำนวณเพื่อเข้าใจอย่างลึกซึ้งถึงอันดรกิริยาระหว่างสารยับยั้งที่มีความจำเพาะสูงในการรักษาโรควัณโรคที่มีต่อเอนไซม์
พรพรรณ พึ่งโพธิ์ มหาวิทยาลัยอุบลราชธานี พ.ศ. 2556 การสำรวจมโนมติทางวิทยาศาสตร์ เรื่อง สารโคเวเลนต์และไอออนิกโดยใช้เทคนิคแบ่งกลุ่มผลสัมฤทธิ์ร่วมกับบัตรแสดงพันธะเคมี
ประนอม แซ่จึง มหาวิทยาลัยราชธานี พ.ศ. 2558 การสังเคราะห์สารอัลคะลอยด์และสารอินทรีย์ที่มีฤทธิ์ทางยา
สมเด็จพระเจ้าลูกเธอเจ้าฟ้าจุฬาภรณวลัยลักษณ์ ฯ มหาวิทยาลัยมหิดล พ.ศ. 2558 การศึกษาพัฒนาวิธีการวิเคราะห์สารเมตาโบไลต์ด้วยเทคโนโลยีไอออนโมบิลิตี้แมสสเปคโตรเมทรีเพื่อให้จำแนกสารเมตาโบไลต์ที่มีโครงสร้างซับซ้อนในผลิตภัณฑ์จากธรรมชาติ: กรณีศึกษาในพืชสมุนไพรคนทีดำ
นฤมล จริยะโสภิต สำนักงานการวิจัยแห่งชาติ (วช.) พ.ศ. 2563 การค้นหาและออกแบบสารยับยั้งกระบวนการสังเคราะห์ผนังเซลล์ที่มีความจำเพาะสูงต่อโปรตีน DprE1 เพื่อเพิ่มศักยภาพในการยับยั้งเชื้อวัณโรคดื้อยาบนพื้นฐานการจำลองแบบโมเลกุลและการออกแบบยาโดยวิธีการคำนวณ
พรพรรณ พึ่งโพธิ์ มหาวิทยาลัยอุบลราชธานี พ.ศ. 2561 แบบจำลองและวิธีการหาค่าเหมาะที่สุดแบบใหม่กับการประยุกต์ในปัญหาไบล์ดอิมเมจดีคอนโวลูชัน
ประสิทธิ์ ช่อลำเจียก สำนักงานการวิจัยแห่งชาติ (วช.) พ.ศ. 2564 การพัฒนาทักษะการวิเคราะห์ทางเคมี ด้วยเครื่องมือวิทยาศาสตร์
นิภาภรณ์ มีพันธุ์ คณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี มหาวิทยาลัยราชภัฏสุราษฏร์ธานี พ.ศ. 2551