การตรวจหาซิงเกิลนิวคลีโอไทด์โพลีมอร์ฟิซึมของยีนในระบบภูมิคุ้มกันที่มีความสัมพันธ์กับความต้านทานโรคไวรัสตัวแดงดวงขาวในกุ้งขาวแวนนาไม (Litopenaeus vannamei Boone, 1931)

บทคัดย่อ

โครงการวิจัยนี้เป็นโครงการวิจัยต่อเนื่องที่มีระยะเวลาในการดำเนินงานวิจัย 2 ปี แต่เนื่องจากในปีที่ 2 โครงการวิจัยนี้ไม่ได้รับการสนับสนุนด้านงบประมาณ ทำให้ไม่สามารถดำเนินงานวิจัยในส่วนของการศึกษาหา SNPs ในยีนที่เกี่ยวข้องกับระบบภูมิคุ้มกันที่มีความสัมพันธ์ต่อความต้านทานโรคจากเชื้อไวรัสตัวแดงดวงขาวได้เมื่อพิจารณาไพรเมอร์ที่ออกแบบได้จำนวน 30 ตำแหน่ง พบว่าสามารถสร้างผลผลิต PCR ได้จำนวน 20 ตำแหน่ง โดยในจำนวนนี้มี 7 ตำแหน่งที่มีขนาดของผลผลิต PCR ไม่ตรงกับที่ออกแบบได้ ทั้งนี้เนื่องจากได้ออกแบบไพรเมอร์จาก mRNA (ยกเว้นยีน Lysozyme ที่ออกแบบมาจาก DNA) และนำไปสร้างผลผลิต PCR โดยใช้ DNA เป็นต้นแบบ ซึ่งจะมีลำดับนิวคลีโอไทด์ของ Intron เพิ่มเข้ามา ทำให้ขนาดของผลผลิต PCR ไม่ตรงกับที่ออกแบบได้ นอกจากนี้ยังมีไพรเมอร์จำนวน 10 ตำแหน่งที่ไม่สามารถสร้างผลผลิต PCR ได้ ทั้งนี้อาจเป็นผลมาจากบริเวณของลำดับนิวคลีโอไทด์ที่ไพรเมอร์เข้าจับเป็นบริเวณที่เกิดกระบวนการ Splicing หรือกระบวนการการตัด Intron ของ RNA นอกจากนี้อาจเกิดจากการมีลำดับนิวคลีโอไทด์ของ Intron ที่เพิ่มเข้ามามีความยาวมาก ส่งผลให้การสร้างผลผลิต PCR ไม่สมบูรณ์ได้

คำสำคัญ