การคัดกรองเสมือนเพื่อค้นหาตัวยับยั้งการทำงานของ Elongation factor 3 (eEF3) ของเชื้อราก่อโรคไหม้ในข้าว (Magnaporthe oryzae)

บทคัดย่อ

โปรตีน Elongation factor 3 (eEF3) ของเชื้อราโรคไหม้ถูกใช้เป็นเป้าหมายในการควบคุมเชื้อรา โรคไหม้ในข้าวเนื่องจาก eEF3 เป็นโปรตีนที่จำเป็นต่อการสังเคราะห์โปรตีนของเชื้อราโรคไหม้ ฐานข้อมูล ของสารประกอบโมเลกุลขนาดเล็กจาก NCI ปี 2007 และฐานข้อมูลสารประกอบที่พบในธรรมชาติของ NCI/NIH ถูกใช้ในการคัดกรองเสมือนด้วยโปรแกรม Schrodinger drug discovery software เพื่อค้นหา ตัวยับยั้งการทำงานของ Elongation factor 3 (eEF3) ของเชื้อราก่อโรคไหม้ในข้าว ผลการค้นหาพบว่า ได้สารประกอบหลากหลายชนิดที่สามารถจับกับ eEF3 ได้ เมื่อเปรียบเทียบกับ ATP ซึ่งเป็นซับสเตรทของ eEF3 โปรตีน Neohesperidin หรือ NSC31048 เป็นสารประกอบที่ได้คะแนนสูงที่สุด และ NSC35611 หรือ Solanine ซึ่งเป็นสารประกอบที่พบในธรรมชาติที่มีสมบัติเป็นพิษ สารประกอบที่ได้คะแนนการ ค้นหาสูงจำนวน 30 ชนิดถูกสั่งมาทดสอบความสามารถในการยับยั้งการเจริญเติบโตของเชื้อราโรคไหม้ พบว่ามีสารประกอบเพียง 6 ชนิดที่มีผลยับยั้งที่ความเข้มข้น 50 ไมโครโมลต่อมิลลิลิตร คือ NSC121182, NSC56097, NSC1683, NSC34443, NSC93086 and NSC691099 โดยสามารถยับยั้งการงอกของ สปอร์เชื้อราดรคไหม้ได้มากกว่า 50 เปอร์เซ็นต์เมื่อเปรียบเทียบกับ Amphotericicin B ที่ความเข้มข้น 2 6.25 ไมโครโมลต่อมิลลิลิตร สารประกอบทั้ง 6 ชนิดนี้จะถูกนำไปทดสอบความสามารถในการยับยั้งการ เจริญเติบโตของเชื้อราโรคไหม้ต่อไป

คำสำคัญ