โรคที่เกิดจากเชื้อโพสไพไวรอยด์ในพริก
ชื่อผู้แต่งข้างต้นเป็นข้อความจากระเบียนผลงาน ไม่ได้ผูกกับรหัสนักวิจัย จึงกดดูผลงานอื่นของบุคคลนี้ไม่ได้ — ในคลังนี้ 142,080 ผลงาน (63.6% ของทั้งหมด) มีชื่อผู้แต่งที่เชื่อมกับหน้าผู้แต่งได้ และ 60,298 ผลงาน (27.0%) มีผู้แต่งที่ผูกกับรหัสนักวิจัยจริง ส่วนอีก 81,382 ผลงานไม่มีข้อมูลผู้แต่งเลย (มีชื่อผู้แต่งเป็นข้อความอยู่ 142,009 ผลงาน = 63.5%)
บทคัดย่อ
จากการสำรวจและเก็บตัวอย่างพริกซึ่งแสดงอาการคล้ายอาการของโรคที่เกิดจากเชื้อไวรอยด์และอาการคล้ายไวรัส ในพื้นที่ จังหวัด กาญจนบุรี นครปฐม นครราชสีมา สุรินทร์ ศรีสะเกษ อุบลราชธานี เชียงราย เชียงใหม่ และ จ. ตาก รวม392 ตัวอย่างภายหลังการตรวจวินิจฉัยเชื้อไวรอยด์ด้วยเทคนิค reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) โดยอาศัยไพรเมอร์ PC-2 ไพรเมอร์ Pospi1 ไพรเมอร์ Vid และไพรเมอร์ CL-3 พบจำนวน 17ตัวอย่างแสดงแถบดีเอ็นเอเป้าหมายของเชื้อไวรอยด์ ซึ่งจากการศึกษาเพื่อระบุชนิดที่ชัดเจนด้วยการโคลนและวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์ และเปรียบเทียบกับลำดับนิวคลีโอไทด์ของเชื้อไวรอยด์ที่มีรายงานในฐานข้อมูลของ GenBank โดยอาศัย โปรแกรม Blastn เพื่อการระบุชนิดของเชื้อไวรอยด์ พบเชื้อ CLVd ในตัวอย่างพริกในจ.นครปฐม คิดเป็น2.5 %จ.สุรินทร์5 %จ.ศรีสะเกษ1.7 %และ จ.เชียงราย1.7 %นอกจากนี้ยังตรวจพบเชื้อไวรอยด์ PCFVdในแปลงพริกในจ.นครราชสีมา คิดเป็น 2.5%จ.สุรินทร์10 %จ.ศรีสะเกษ10 %จ.อุบลราชธานี7.5 % และจ.เชียงราย1.7 %จากการศึกษาครั้งนี้เชื้อไวรอยด์ที่พบในพริกเป็นเชื้อColumnea latent viroid (CLVd) และเชื้อPepper chat fruit viroid(PCFVd) ซึ่งเป็นเชื้อที่เคยมีรายงานพบแล้วในบ้านเราแสดงว่าจากตัวอย่างที่ทำการสำรวจยังไม่ปรากฏเชื้อไวรอยด์ชนิดใหม่ในช่วงเวลาที่ทำการสำรวจ อย่างไรก็ตามควรต้องให้ความรู้กับเกษตรกรให้ใช้เมล็ดพันธุ์ที่ปลอดเชื้อหรือจากแหล่งที่เชื่อถือได้เพื่อป้องกันการอุบัติซ้ำของโรค เพราะจากการสำรวจในแปลงปลูกพบเชื้อในสภาพธรรมชาติแสดงว่าน่าที่จะมีการติดมากับเมล็ดพันธุ์ที่เกษตรกรนำมาปลูก สำหรับการทดสอบหาไพรเมอร์ที่มีความจำเพาะกับเชื้อ PCFVd ในพริก โดยการใช้ไพรเมอร์ที่มีรายงานอยู่ก่อนแล้ว ไพรเมอร์ที่ออกแบบใหม่ และไพรเมอร์ที่มีการจับคู่ใหม่ รวมทั้งสิ้นจำนวน 15 ไพรเมอร์ ได้แก่ไพรเมอร์ที่จะให้ PCR ผลผลิตแบบเต็มจีโนม จำนวน 6 ไพรเมอร์ และแบบบางส่วนของจีโนม จำนวน 9 ไพรเมอร์ จากการตรวจสอบด้วยเทคนิค RT-PCR พบว่าไพรเมอร์ ที่ให้ PCR ผลผลิตแบบเต็มจีโนมจำนวน 2 ไพรเมอร์ คือ ไพรเมอร์ PCF-seq ซึ่งเป็นไพรเมอร์ที่รายงานไว้โดย Yanagisawa และ Matsushita ปี ค.ศ. 2017และ ไพรเมอร์ PCFVd-348 ซึ่งเป็นไพรเมอร์ที่ออกแบบใหม่ในการศึกษาครั้งนี้ และแบบให้ PCR ผลผลิตบางส่วนของจีโนม จำนวน 1 ไพรเมอร์ คือ ไพรเมอร์ Test-8 ซึ่งเป็นไพรเมอร์ที่เคยรายงานไว้ก่อนแล้วแต่นำมาจับคู่สำหรับทดสอบใหม่และเมื่อทดสอบกับเชื้อไวรอยด์ในกลุ่ม Pospiviroid ด้วยกัน ได้แก่ Chrysanthemum stunt viroid (CSVd), CLVd, Potato spindle tuber viroid (PSTVd), Tomato apical stunt viroid (TASVd) และTomato chlorotic dwarf viroid (TCDVd)พบว่าทั้ง 3 ไพรเมอร์มีความจำเพาะเจาะจงต่อเชื้อ PCFVd เท่านั้น