การใช้เทคนิคทางอณูชีววิทยาในการจัดจำแนกชนิดของสาหร่ายขนาดเล็กและไดอะตอม
ชื่อผู้แต่งข้างต้นเป็นข้อความจากระเบียนผลงาน ไม่ได้ผูกกับรหัสนักวิจัย จึงกดดูผลงานอื่นของบุคคลนี้ไม่ได้ — ในคลังนี้ 142,080 ผลงาน (63.6% ของทั้งหมด) มีชื่อผู้แต่งที่เชื่อมกับหน้าผู้แต่งได้ และ 60,298 ผลงาน (27.0%) มีผู้แต่งที่ผูกกับรหัสนักวิจัยจริง ส่วนอีก 81,382 ผลงานไม่มีข้อมูลผู้แต่งเลย (มีชื่อผู้แต่งเป็นข้อความอยู่ 142,009 ผลงาน = 63.5%)
บทคัดย่อ
งานวิจัยนี้ มีวัตถุประสงค์เพื่อจําแนกชนิดและสกุลของสาหร่ายสีเขียวแกมน้ําเงินน้ําเค็มและไดอะตอมโดยใช้ลําดับของยีนไฟโคไซยานิน ส่วนของ International Transcribed Spacer (ITS) และ 18S rDNA ตามลําดับสกัดจีโนมิกดีเอ็นเอของสาหร่ายด้วยวิธี Phenol:Chroloform และเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอด้วยปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรส แล้วตรวจสอบชนิดและสกุลของสาหร่าย โดยเปรียบเทียบลําดับนิวคลีโอไทด์ที่ได้กับลําดับนิวคลีโอไทด์ในห้องสมุดยีน นอกจากนี้ ได้ศึกษาลายพิมพ์ดีเอ็นเอของสาหร่ายด้วยวิธี RAPD-PCR ด้วยไพรเมอร์ขนาด 10 คู่เบสแล้วคัดเลือกเครื่องหมาย RAPD ที่จําเพาะต่อชนิดของสาหร่ายที่สนใจมาหาลําดับนิวคลีโอไทด์ ออกแบบไพรเมอร์สําหรับเครื่องหมาย SCAR ของสาหร่ายจากผลการวิจัยสามารถจัดจําแนกชนิดและสกุลของสาหร่ายสีเขียวแกมน้ําเงินได้ 9 ชนิด และไดอะตอมได้2 ชนิด คือ สาหร่ายสีเขียวแกมน้ําเงินไม่ทราบสกุล รหัส MT5 คล้ายกับสาหร่ายสีเขียวแกมน้ําเงินSynechococcus sp. (97% identity, e-value = 3e-32) สาหร่ายสีเขียวแกมน้ําเงินไม่ทราบสกุล รหัส MT6คล้ายกับสาหร่ายสีเขียวแกมน้ําเงิน Synechococcus sp. (97% identity, e-value = 0.0) สาหร่ายสีเขียวแกมน้ําเงินไม่ทราบสกุล รหัส MT6C คล้ายกับสาหร่ายสีเขียวแกมน้ําเงิน Synechococcus sp. (97% identity, e-value= 0.0) สาหร่ายสีเขียวแกมน้ําเงินไม่ทราบสกุล รหัส MT0 คล้ายกับสาหร่ายสีเขียวแกมน้ําเงิน Synechococcussp. (97% identity, e-value = 9e-158) สาหร่ายสีเขียวแกมน้ําเงินไม่ทราบสกุล รหัส MT2 คล้ายกับสาหร่ายสีเขียวแกมน้ําเงิน Synechococcus sp. (97% identity, e-value = 0.0) สาหร่ายสีเขียวแกมน้ําเงินไม่ทราบสกุลรหัส MT4 คล้ายกับสาหร่ายสีเขียวแกมน้ําเงิน Synechococcus sp. (97% identity, e-value = 0.0) สาหร่ายสีเขียวแกมน้ําเงินไม่ทราบสกุล รหัส MT14 คล้ายกับสาหร่ายสีเขียวแกมน้ําเงิน Synechococcus sp. (97%identity, e-value = 0.0) สาหร่ายสีเขียวแกมน้ําเงิน รหัส MT7K คล้ายกับสาหร่ายสีเขียวแกมน้ําเงินChroococcus disperses (74% identity, e-value = 3e-69) ไดอะตอม รหัส MT34 คล้ายกับไดอะตอมChaetoceros gracilis (94% identity, e-value = 0.0) ไดอะตอม รหัส FD1 คล้ายกับไดอะตอม Chaetocerosgracilis (97% identity, e-value = 0.0)จากการหาลําดับนิวคลีโอไทด์ของครื่องหมาย RAPD ที่จําเพาะต่อสาหร่าย Synechococcus sp. และSpirulina sp. พบว่าเป็นลําดับนิวคลีโอไทด์ของยีน glucosidase (Cecembia lonarensis, e-value = 6e-160)DNA mismatch repair protein MutS (Arthrospira platensis NIES-39, e-value = 0.0) และ alphaamylase (Arthrospira sp., e-value = 2e-175) ส่วนครื่องหมาย RAPD ที่จําเพาะต่อสาหร่าย Chroococcussp. และสาหร่ายสีเขียวแกมน้ําเงินไม่ทราบสกุล รหัส MT22 ไม่สามารถหาลําดับนิวคลีโอไทด์ได้ โดยเมื่อออกแบบไพรเมอร์สําหรับพัฒนาเป็นเครื่องหมาย SCAR โดยใช้ลําดับนิวคลีโอไทด์ของครื่องหมาย RAPD พบว่าลําดับนิวคลีโอไทด์ของยีน DNA mismatch repair protein MutS สามารถแยกสาหร่าย Spirulina sp. ออกจากสาหร่ายสีเขียวแกมน้ําเงินชนิดอื่นได้ ผลการวิจัยนี้ทําให้เราสามารถระบุสกุลและชนิดให้กับสาหร่ายได้โดยที่ใช้เทคนิคทางอณูชีววิทยา อีกทั้งยังสร้างดีเอ็นเอบาร์โคดให้กับสาหร่ายที่ศึกษาได้อีกด้วย